根據規劃，基地主要任務是建設海峽西岸區域研發中心，將其打造為以企業為主體的聯合研發中心、構建行業共性技術服務平臺、建設企業創新支撐平臺、構筑兩岸研發機構集中區；以高新技術產業、先進制造業、現代服務業和現代農業為重點，成為率先突破制約兩岸科技合作交流體制機制障礙的先行先試基地，成為海峽西岸經濟區與臺灣經濟全面對接的前沿平臺；至2015年，引進、孵化臺資企業、臺灣學者創業企業500家，新增工業產值1000億元以上；吸引臺灣企業或高校院所來廈設立研發機構50家，吸納或建立10家臺資科技創業風險投資企業；引入臺灣人才培訓機構10家、創新團隊100支、各類專業技術人才1000名。
為促進閩臺科技合作與交流向更深層次和更高水平發展，繁榮海峽西岸經濟區發展，發揮科技支撐和引領作用，廈門市政府近年投入大量資金先后建成廈門火炬（翔安）產業區、軟件產業基地、集美機械工業區和同安工業集中區四大高新技術產業發展園區。在這些工業產業園區內，已聚集了相當規模的臺商企業和臺灣科技創業者。（記者張建琛）
