依據兩會最新簽署的《海峽兩岸醫藥衛生合作協議》，兩岸將就傳染病的檢疫與防疫、資訊交換與通報、重大傳染病疫情處置、疫苗研發及其他事項，進行交流與合作。

　　根據協議，傳染病范圍、類別依雙方各自規定及商定辦理。在檢疫與防疫措施方面，雙方同意依循公認檢疫防疫準則所規范的核心能力，加強合作，采取必要檢疫及防疫措施，避免或減少傳染病傳播至對方。雙方同意對在己方發現對方的疑似或確診傳染病病人，進行適當處置或協助返回原居住地治療。

　　在傳染病疫情資訊交換與通報方面，雙方同意平時應以書面方式定期互相交換傳染病疫情及衛生檢疫等資訊。雙方同意盡速通報可能或已構成重大突發公共衛生事件的傳染病疫情，并持續溝通及通報相關資訊。如接獲對方查詢時，應盡速給予回應與協助。重大疫情通報的內容，包括病例定義、實驗室檢驗數據、疫情來源、病例數、死亡數及采取的防治措施等。必要時，雙方得商定變更通報內容。如有對方人民在發生重大疫情方受感染的資訊，該方應通報對方。

　　在重大疫情處置方面，協議提出，發生重大疫情方應即時采取有效監測及處置措施；必要時，得請求對方積極提供協助。發生重大疫情方，于對方請求時，應提供疫情調查情況，并積極考量協助對方實地了解疫情。

　　雙方還同意就共同關切的傳染病防治策略、檢疫標準、處置措施及其實務演練、檢驗技術與實驗室標本以及疫苗研發等，進行交流與合作。

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